hallo
das könntest du mit ganz wenig php erledigen, kenn mich mit javascript nicht wirklich aus darum weiche ich auf php um ;)
also..
<a href="javascript:openPageInPopup('index.php?anker=blabla');">link</a>
und im index.php müssest du dan beim frame main das file in diesem stil angeben: <frame src="main.htm#<?=$anker?>" name="main">
gruss