Die MySQL Workbench sieht vielversprechend aus, ist aber noch in der Entwicklung und die Alpha Version ist kaum praktisch nutzbar.
Die MySQL Workbench ist der nachfolger des DB Designer 4 (http://fabforce.net/dbdesigner4/). Der DB Designer funktioniert soweit ich das bis jetzt beurteilen konnte einwandfrei.
Du kannst dich mit ihm auch direkt mit einer MySql DB verbinden.
Ich kann ihn nur empfehlen.
Ich bin letzlich doch wieder bei phpMyAdmin geblieben.
phpMyAdmin ist kein Tool zum modellieren.
Grüße
Sascha