Daher wollte ich wissen, wie man diese Daten besser "speichern" kann.
außerhalb des document root deiner Seite - sonst kannst du nicht viel tun.
Viel wichtiger ist aber:
a) arbeite nicht mit "root" rechten in einer Produktivumgebung, erstelle dafür einen eigenen Benutzer der nur die nötigen Rechte hat - GRANT oder vergleichbares braucht der sicher nicht.
b) erlaube nur Verbindungen von der IP Webservers bzw. von localhost.