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Eleganter wäre es, das Problem über eine entsprechende Konfiguration des Webservers zu lösen.
da gibts doch cgiwrap, das genau das tut?! http://www.cc.ukans.edu/~acs/docs/other/cgiwrap.shtml
Hm, wer das installieren darf (und zwar unter root-Berechtigung und mit root-s-Bit - die personifizierte potentielle Sicherheitlücke sozusagen), für den wäre es durchaus eine Möglichkeit.
Der "private" Perl-Interpreter ist viel ungefährlicher.