Negotiating Transfer heißt, das Go!Zilla und Webseite sich aufeinander abstimmen. Kommt tatsächlich vor jedem Download. [negotiate = verhandeln, zustandebringen... ]
Wenn der zu lange dauert, kriecht entweder die Seite oder Deine Verbindung. Möglicherweise zu viele gleichzeitige Downloads vom selben Server.
Zum zweiten Problem: Auto->Browser Integration einschalten. Unter Go->Options->Automation einrichten.
Gruß, ThK