Ja. Der IE hat definitiv Probleme mit großen Tabellen.
Workaround:
Tabelle onload via Javascript unsichtbar und gleich wieder sichtbar machen.
Habe ich bei dieWohnung.de auch so machen müssen. Da neigte der IE 6 dazu ganze Zeilen zu verschlucken, was auch nur auffiel, weil diese verschiedene Hintergrundfarben haben.
fastix