Hallo,
muss es denn unbedingt ein Popup sein?
Da Du ja ohnehin JavaScript benutzen musst für ein Popup könntest Du doch auch mit einem Div arbeiten. Das passt sich automatisch der Textmenge an (wenn es zu klein dimensioniert war).
In dem Div baust Du irgendwo einen Button ein, der dann das DIV wieder unsichtbar machen kann, wenn es gelesen wurde. Mit einer speziellen Funktion (schau mal nach bei http://www.stempelgeheimnis.de) kannst Du das Div auch verschieben.
Grüße
Tom