Hi!
Am Besten ginge es mit Cron-Jobs. Läßt sich aber auch mit PHP realisieren. Zwar nicht so schön, aber es sollte gehen.
Und zwar musst du in eine häufig aufgerufene Datei (Am besten die Startseite) einen Script einbauen, der prüft ob eine (oder mehrere) der 1000 .dat Dateien über der vorgegebenen Zeit liegt. Diese musst du dann automatisch löschen lassen.
Guck mal unter: http://www.php.net/manual/de/ref.filesystem.php und dort unter filemtime und unlink.
Mfg
Elessar