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Hi,
das kommt ganz auf geplante Seite an...
Bei einem Weblog oder Forum mit täglich neuen Einträgen oder einem umfangreichen Produktkatalog würde ich auf jeden Fall DB nehmen, allein schon wegen performanten Suchfunktionen.
Bei kleinen Webseiten oder großen mit nicht so häufiger Aktualisierung würde ich bei Flatfiles bleiben. Hier kannst Du CVS, XML oder eigene Formate für die eigentlichen Daten nehmen, je nach Verwendungszweck. Für ein verschachteltes Menü eignet sich XML ganz gut.
MfG
Danny