Hallo Michael,
Du brauchst die httpd.conf nicht von Hand zu bearbeiten. Im Admin-Bereich von Confixx gibt es unter "Einstellungen" den Menüpunkt "http spezial". Dort kannst Du für jeden Virtual Host zusätzliche Einträge vornehmen, die dann automatisch in die confixx_vhost.conf eingetragen wird, wo ohnehin sämtliche Konfigurationsanweisungen der durch Confixx angelegten Domains gespeichert sind. (Es würde also auch gar nichts nützen, die httpd.conf selbst zu bearbeiten. Auch die confixx_vhost.conf bitte nicht direkt bearbeiten, weil die Datei von Confixx immer wieder neu angelegt wird).
Safe Mode kannst Du mit "php_admin_flag safe_mode Off" ausschalten, was alerdings generell keine besonders gute Idee ist.
Aber Vorsicht: falsche Einträge in confixx_vhost.conf halten den Server an! In diesem Fall musst Du Dich per SSH auf der Maschine einloggen, die Datei confixx_vhost.conf suchen und die dort eingetragene (falsche) Anweisung löschen. Anschließend unbedingt den falschen Eintrag auch im Confixx-Formular ändern, sonst schreibt Confixx den Fehler bei nächsten Reload wieder in die Datei rein.
Im Endkundenbereich gibt es außerdem eine Option, dass CGI auch außerhalb von CGI-Bin ausführbar sein soll. Wenn Du die aktivierst, müsste es eigentlich gehen.
Gruß,
Serjosha