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Hallo Andre,
Auch für größere Uploads ist HTTP geeignet, es gibt ja sogar eine Erweiterung von HTTP zur Dateiverwaltung. Man muss halt den Server entsprechend Konfigurieren.
Wenn für die Sicherheit wirklich eine Rolle spielt, dann schließt das den Einsatz eines unverschlüsselnden Protokolls aus. Du solltest Dir also gut überlegen, ob Du das wirklich nicht brauchst.
SFTP hat gegenüber FTP meiner Meinung nach keine Nachteile.
Um Dateien mit FTP hochzuladen, ist auch ein spezieller Client notwendig und es gibt hinreichend viele Clients, die SFTP unterstüzen.
Grüße
Daniel