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[Christian]

Hallo.

Da die Seite bzw. das PopUp aber dynamisch generiert wird, auf was soll ich denn dann beim href-Attribut verweisen? Das raff ich nicht so ganz...

Was verstehtst du unter "dynamisch generiert"? Ich dachte dir stehen keine serverseitigen Sprachen zu Verfügung.
Oder wird der Dokumentbaum mittels JavaScript manipuliert bzw. der Dokumentinhalt mittels JavaScript geschrieben?

Das Öffnen eines Pop-Ups und laden einer html-Seite in dieses ist noch nichts wirklich dynamisches.
Das Pop-Up ist für den Browser ein Fenster wie jedes andere auch. Du Verweist im href Attribut also wie sonst auch auf die Seite, die du im Pop-Up öffnen möchtest. Relative URLs beziehen sich in diesem Fall auf den Pfad relativ zur URL des Pop-Ups.

Grüße
  Christian