Hallo Tina,
die Dokumentation zu String.replace() hast Du siocherleich gelesen. Dort ist ein Beispiel, wo das Wort Hinz ersetzt wird. Es ist unerheblich, ob DU nur ein Zeichen oder mehrere Zeichen tauschen möchtest - das Prinzip bleibt gleich. Sind mehrere Einzelzeichen zu ersetzen, so wie bei Dir, dann ist die replace()-Methode mehrfach anzuwenden; entweder in einer Schleife oder direkt verketten:
str = str.replace(/W/g,"D").replace(/Q/g,"N");
Mit freundlichem Gruß
Micha