Hi,
ich bin da auch noch nicht soweit, aber ich nehme schwer an, dass das mit der Größe deiner transparenten Datei zu tun hat. Du hast zwar angegeben "height="ziemlich viel" und width="auchviel", aber wahrscheinlich nimmt der ie dass nur für den Fall, dass das Laden des Bildes nicht klappt.
Probier mal, ob du die Größe des umgebenden Div Containers ändern kannst, vll wird das Bild dann größer.
Oder lass gleich das Transparent weg, und lege eine Tabelle über die Stellen auf der Bild Datei (mit css positionieren).
Die Tabelle lässt sich dann mit Javascript (ziemlich sicher) als Link benutzen, stelle ich mir so vor:
<table height="500px" width="300px" onclick"location.href='url'">
<tr><td></td></tr>
Probiere das mal aus, und sage mir, obs geklappt hat!