Hi
mein Server w2003R2 bootet gelegentlich, wenn Microsoft nächtens mal wieder ein update einschiebt.
ich habe von Windows wenig Ahnung aber vermute, Du solltest in der Systemsteuerung mal unter "Update-Service" suchen o.s.ä.
Ansonsten Anfrage bei MSoft und/oder mal über Google suchen, ob man das von Hand in der Registry einstellen kann.
Zur Not: Update abschalten und regelmäßig von Hand starten.
Gruß
Reiner