Mal in eine ganz andere Richtung: Vielleicht ist das Software as a Service (SaaS)-Konzept für dich attraktiver als der Verkauf von Lizenzen.
Man kann zB beim Woltlab Burning Board sehen, dass andere Konzepte nicht aufgehen. Gerade wenn die meisten Kunden im Consumer-Umfeld zu finden sind, lässt sich sowas nicht vermeiden.
Ansonsten ist für dich vielleicht Zend Guard (http://www.zend.com/de/products/guard/) eine Option, die kostet aber.