While-Schleife läuft nur einmal durch

[Moe]

Array ( [0] => Array ( [0] => 1 [fragen_id] => 1 ) [1] => Array ( [0] => 2 [fragen_id] => 2 ) )

Das heisst im Prinzip, dass deine Anfrage 2 Ergebnisse zurückliefert.
Wenn du jetzt per foreach() über das Ergebnis iterierst sollte es funktionieren.
Also so:

  
foreach(mysql_fetch_all($query) as $key) {  
  echo $key[0]; // oder auch echo $key['fragen_id']  
}