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Hallo,
Du solltest definitiv auf PDO und Prepared Statments (SELECT * WHERE x=?) setzen. PDO ist offiziell erst ab PHP 5.0 dabei; aber es gibt eine Fallback-/Emulation für ältere PHP-Versionen:
http://www.xpdo.org/api/xpdo-pdo/_pdo.class.php.html
MDB2 oder ADODB werden erst wirklich dann interessant, wenn du komplexe Tabellendefinitionen zur Laufzeit erstellen willst. (Binary BLOBs und einige Funktionen haben z.B. in MySQL und Postgres unterschiedliche Namen.)
G!
mario