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Scriptfehler kann ich eigentlich ausschließen, da erstens das Script auf dem anderen Server einwandfrei lief und zweitens das Script bei kleineren XML-Dateien funktioniert.
Wenn du das kannst, dann kannst du auch die Logfiles definieren und checken. Steht da was drin? Welche Dateien hast du überhaupt geprüft?
Ich habe die syslog und die error.log von Apache kontrolliert. Da ist eindeutig nichts auffälliges drin.