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Ähm -super. Erklär mir bitte, wie ein Problem nicht datenbankseitig sein soll, wenn auf immer gleiche Abfragen für gewisse Rows die Ausgabe wunderschön geschieht, bei anderen (immer gleichen) aber Zeichenfehler auftreten? Dann muss dies doch gezwungenermasse an fehlender "Zeichenkodierungskonsistenz" auf Seite der DB liegen.
Entsprechende Felder präsentieren sich übrigens auch in phpMyAdmin mit ?, während dies andere nicht tun...
So wie ich das sehe, bedeutet dies, das du die DB zwar richtig ausließt, das jedoch dort schon Fehler drin sind.
Wie kommen die Daten da rein? Von dir? Wenn ja würde ich an der Stelle ansetzten. Da du ein Mischmasch aus richtig und falsch im PHPmyAdmin hast könnten es auch Altlasten sein.