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Es werden auch Grafiken eingebunden.
Was für Grafiken sind das? Pixel/Vector?
Für pdfLatex verwende ich nur noch Grafiken, die im pdf-Format vorliegen. Wenn es Vectorgrafiken sind, werden diese verlustfrei eingebunden.
Wenn es sich bei Dir um Pixelgrafiken handelt:
png: damit kann es Probleme geben, wegen des Alphakanals
Schreib mal erstmal, was für Grafiken du verwendest.
Cheers,
Baba