Tach!
Auf was kann ich noch zurückgreifen um die Ursache dieser Überlastung herauszufinden?
Generell gesagt, ein Monitoring-Tool wie Munin verwenden, dann siehst du was normal ist und was ausschlägt. Aktuell kann man mit top oder schöner htop sich das Geschehen anzeigen lassen. Damit sieht man die Prozessor- und Speicherauslastung. Für Plattenzugriffe gibt es auch noch iotop. Das wäre ein Anfang. Weiterhin kann man über die Zugriffe im Access-Logs erkennen, was aufgerufen wird. MySQL hat auch noch Logs, zum Beispiel das Slow-Query-Log.
dedlfix.