Dann stellt sich die Frage, ob Du Transaktionen benutzen willst. Ist die Antwort "Ja", dann ist die Antwort auf die Frage, ob MyISAM das richtige Backend sei, ein klares "Nein".
Die Antwort auf die Frage "MyISAM oder InnoDB?" lautet schon seit Jahren ziemlich pauschal "InnoDB", Ausnahmen wären nötige Features, die InnoDB nicht kann. Oder wg. mir auch irgendwelche Inkompatiblitäten alter Software. Sonst überwiegen die Vorteile deutlich, ich werfe nur mal row-level-locking in den Raum.