Du wirst doch sicher sowas haben wie ein <ul> für die Hauptnavigation und ein <ul> für die Subnavigation. Gib den beiden ul unterschiedliche Klassen und dann kannst Du gezielt suchen
var mainActive = $("ul.navMain li.active").attr(id),
subActive = $("ul.navSub li.avtive").attr(id)
und du hast die IDs der aktiven Tabs für Haupt- und Subnavigation. Wobei ich nicht weiß was attr() zurückgibt wenn es auf einem leeren Set aufgerufen wird (sprich: keine Subnavigation existiert oder kein li mit active Klasse da ist).
Hilft das ?
Gruß Rolf