Hmmm das bringt mich leider nicht weiter:
RewriteBase /
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule ^(.*)$ %{HTTP_HOST}/$1
In diesem Fall bearbeitet er die Rule anscheinend gar nicht und öffnet die index.php in ~/html.
Meine Verzeichnis-Struktur sieht so aus:
~/html
~/html/.htaccess
~/html/domain1.de/index.php
~/html/domain2.de/index.php
~/html/www.domain1.de/index.php
~/html/www.domain2.de/index.php
Und ich versuche diese URL aufzurufen: https://www.domain1.de
... und würde erwarten, dass er die entsprechende index.php aufruft.