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Geräte am COM Port dürften für PHP kein Problem sein. Komplizierter wirds auf USB, da solltest Du Dich mal selbst informieren was da geht mit PHP. Evntl. brauchts auch die LibUSB.
Wie sowas in Perl aussieht, kannst Du Dir hier mal anschauen, das Modul ist von mir.
MfG
TS