<Directory …>
…
IndexOptions Charset=UTF-8 HTMLTable FancyIndexing IgnoreCase VersionSort SuppressHTMLPreamble SuppressRules TrackModified SuppressDescription XHTML FoldersFirst
HeaderName /autoindex-files/header.html
ReadmeName /autoindex-files/footer.html
IndexIgnoreReset ON
IndexIgnore *.deleted *~ .description.md .description.json
</Directory>
Die unter HeaderName und ReadmeName genannten Dateien dürfen nicht auf ".php" enden (das gab einen 500er). Aber: Zumindest wenn PHP als Modul läuft wirft der Apache die unter HeaderName und ReadmeName genannten Dateien trotz der Endung ".html" dem PHP zum Abarbeiten in den Schoß.
Warnung:
Das ist (wohl, habs nicht gefunden) nicht dokumentiert, kann demnach quasi jederzeit entfallen.