Wie MySQL-InnoDB Tabellen auf einen anderen Server übertragen?

[Glaskugelinterpreter]

Ich hatte auf dem Zielsystem zunächst die gesamte Datenbank manuell (über phpmyadmin) gelöscht,

Es ist nur schwer vorstellbar, dass dann

use MYDB;

keinen Fehler ausgeworfen haben soll.

Versuch es mal mit:

mysql -u backup -p MYDB < MYDB.sql >> output.log 2>> output.log

und zeige uns dann output.log vollständig.