Der Nachteil ist daß man die von der Fritzbox ausgehenden Requests zwecks Debugging nicht kontrollieren kann.
Du willst also "volle Kontrolle"?
Dann kauf Dir ein reines DSL-Modem und "bau" Dir den Router und das Drumherum (Firewall, DNS, DHCP, NTPD, VoIP, ...) aus freier Software. Ein Raspi dürfte dafür aber nicht ganz genügen, weil Du dann entweder die WAN- oder die LAN-Seite (mit Switch und Access-Point) via USB anschließen musst und die 5Gbit von USB3 dann ein sehr theoretischer Wert sind…