Stört sich eine Suchmaschine daran, wenn ein
<link rel="canonical" href="https://example.com/index.html">
auf die Seite selbst verweist?
IMHO nicht. Mir fällt auch kein plausibler Grund ein, warum. Im Gegenteil hast Du dann sogar noch einen theoretischen Vorteil: wenn jemand Deine Inhalte unbedarft „klaut“ und an fremder Stelle publiziert, tut er Dir sogar einen Gefallen, indem er auf das Original verweist.