Aloha ;)
Noch ein Vorschlag: Spricht für dich was dagegen, mal das flatpak auszuprobieren?
Dass du das nicht produktiv verwenden willst, habe ich verstanden, aber ein rein experimentelles mal-öffnen könnte vielleicht bei der Fehlersuche helfen.
Denn wenn das flatpak tut und die normale Paketlösung nicht, dann ist mit exorbitanter Wahrscheinlichkeit tatsächlich eine nicht gut aufgelöste Abhängigkeit zu dritt-Paketen das Problem und man könnte dann ggf. in diese Richtung zumindest weitersuchen.
Wenn flatpak auch nicht tut, dann brauchen wir in Richtung Libraries und Drittsoftware als Ursache gar nicht mehr zu schielen.
Grüße,
RIDER