nur um sicher zu gehen:
$var=´uptime´;

Nein,
  $var = uptime;
waere richtig. (Backticks sind die von links oben nach rechts unten, vgl. Backslash.)

oder
$var=qx/uptime/;
ist das korrekt?

Das hier ja. Wenn Du aber den / als Teil der Befehlszeile haben willst, musst Du Dir einen anderen Delimiter suchen:
  $var = qx|/home/me/myprog|;

So long