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Ich nehme mal an, daß die Glassteine nicht in 16 Millionen verschiedenen Farben erhältlich sind, sondern nur in 8 oder so. Deshalb ist ein JPG als Ausgangspunkt denkbar ungeeignet. Du solltest eine Farbpalette anlegen, die genau aus den Farben besteht, in denen die Steine erhältlich sind, und Dein Bild auf diese Palette reduzieren.
... und danach das Bild in einem möglichst einfachen Pixel-Bildformat abspeichern (BMP?) und mit einem kleinen Programm eine Schleife über alle Bildpunkte laufen lassen und einfach mitzählen.
(Falls das Erstellen eines solchen Programms "im Budget drin ist". ;-)