Hallo Martin,
Du kannst in der .htaccess-Datei folgende Direktive angeben:
XBitHack Full
Dadurch werden alle Dateien, die ausführbar sind, geparst.
Dementsprechend musst Du also alle Dateien, die ausgeführt werden sollen, auch mit chmod als ausführbar kennzeichnen.
Weiterführende Hilfe bringt die Apache Dokumentation (http://httpd.apache.org/docs/mod/mod_include.html#xbithack).
Beste Grüsse
Jan