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Hallo!
ich würde das mit http://de.mysql.com/documentation/mysql/bychapter/manual.de_toc.html#mysql machen, diesen Befehl kannst Du in PHP mit system() http://www.php.net/manual/de/function.system.php aufrufen, vorausgesetzt MySQL ist auf demselben Rechner wie PHP installiert!
Grüße
Andreas