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Ok, jetzt etwas klarer geworden.
Bei der Aufteilung von Frames erfolgt immer die Teilung von ganz linker Grenze (Fensterrand) bis ganz rechter (bzw. analog oben / unten). Diese Einteilung dürfte innerhalb eines Framesets (einer Datei) nicht änderbar sein.
Weiß ja nicht wie Deine Seite genauer aussieht, aber Du könntest das ganze etwas weiter aufteilen. D.h. Du definierst einma eine Zweiteilung und lädst jeweils in diese Franme eine Datei, die nochmals in zwei Frames teil. So wären zumindest alle von einander unabhängig.
Interessant wird dann nur die frameübergreifende Verlinkung...
Grüße aus Würzburg
Julian