Hallo Melanie
Das beste wäre wohl, das Applet so zu programmieren, dass es erst nach einem Methodenaufruf von JS aus aktiv wird.
Wenn Du das nicht kannst, kannst Du das Applet natürlich auch erst bei bedarf einbinden. Beispiel:
<div id="test"></div>
<a href="#" onclick="document.getElementById('test').innerHTML = '<applet code='HelloWorld' width='150' height='25' codebase='http://selfhtml.teamone.de/javascript/objekte/anzeige/'></applet>';return false;">click</a>
Grüße
Daniel