Vielleich ein Trick?
Wenn du die Sequenz ändern würdest zu:
Startseite --> öffnen des PopUps --> Schließen des Fenster mit der Startseite --> vom PopUp aus eine andere Seite im neuen Fenster öffnen.
Was soll das? Nun ja, ist Betrug, aber jetzt wäre das PopUp-Fenster immer der 'opener' vom Hauptfenster
Oder noch anders - Du verwandelst direkt das Startseiten-Fenster in das PopUp und öffnest die anderen Inhalte ausserhalb