Du hast an die Zugriffsrechte gedacht?
Das wäre der erste Fehler, der mir einfiele, wenn ich an Windows=geht und Unix=geht_nicht denke.
Wenn der webserver (Wird unter Linux meist al Benutzer gestartet) die Dateien nicht ausführen darf kommt eine Fehlermeldung.
chmod ...
Dazu brauchst Du ein gutes FTP- Programm...
fastix