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Hallihallo!
Wenn Du die Fenster direkt an passender Stelle öffnen willst, ist das hier vielleicht das Richtige für Dich:
http://http://selfhtml.teamone.de/javascript/objekte/window.htm#open
(Aber Popups sind nicht besonders beliebt ;) )
Wenn die Fenster schon da sind, dann kann man ihnen nachträglich neue Abmessungen
(http://http://selfhtml.teamone.de/javascript/objekte/window.htm#resize_to oder http://http://selfhtml.teamone.de/javascript/objekte/window.htm#resize_by)
und neue Positionen
(http://http://selfhtml.teamone.de/javascript/objekte/window.htm#move_to)
geben.
Bedingung dafür ist allerdings, daß die entsprechenden Fenster auch Namen haben.
Ich hoffe, damit konnte ich Dir helfen...
Viele liebe Grüße,
Der Dicki