Hallo!
Deine Javascripte kannst Du z.B. in script.js speichern und den HTML-Quelltext in wasauchimmer.html. In Deine Seiten fügst Du dann folgendes ein:
<script type="text/javascript" src="menu.js"></script>
für Dein Javascript und
<!--#include virtual="wasauchimmer.html" -->
für Deine HTML-Quelltexte. Die wasauchimmer.html Datei braucht kein <HTML> Tag zu enthalten wenn sie mitten in der Seite eingefügt wird.