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Gibt es doch eine Möglichkeit, dem visited link eine andere Farbe zu geben, obwohl das jeweilige <a>-Element einzeln direkt formatiert werden muss?
Ein Arbeitsentwurf des W3C sieht vor, dass man :visited, ... auch im style-Attribut verwenden kann. Ich kenne allerdings keinen Browser der das schon unterstützt. Das ist im Prinzip auch gut so, Arbeitsentwürfe sollten nur in experimentellen Anwendungen implementiert werden. Wenn du keine Möglichkeit hast, <link> oder <style> einzusetzen, bleibt dir nur noch JavaScript.
Wie dem auch sei, das ist ein soziales Problem, kein technisches. Wenn in diesem System deine Regeln überschrieben werden, dann ist das entweder von den Verantwortlichen dafür explizit gewünscht und du sollst nicht versuchen das zu umgehen, oder es ist ein Fehler den es dann zu beheben gilt.