Hallo,
Wenn Du unbedingt was kompilieren willst, dann wandle das ganze Projekt incl. der HTML- Dateien in das .chm- Format. Dann werden die Dateien, die externen Style- Sheets oder eben das in den .js- Dateien enthaltene externe JavaScript nur schwer sichtbar zu machen sein.
Diese Moeglichkeit sehen die kostenlos erhaeltlichen Erstellungswerkzeuge direkt und offiziell vor:
hh -decompile c:\x c:\y\z.chm
entpackt z.chm nach c:\x.
Dieser Aufruf steckt auch hinter dem Menuepunkt File|Decompile... des HTML Help Workshops (hhw.exe).
MfG, Thomas