Hallo Lars,
ja sorry, irgendwie habe ich den Titel nicht so richtig beachtet ;-)
Versuche mal folgendes:
Setze scrolling="no" und in der Datei, die in den Frame geladen wird
<style type="text/css">
<!--
html,body {height: 100%; width: 100%; margin: 0px; padding: 0px; overflow: auto;}
-->
</style>
Das sollte dein Problem lösen.
Und bezüglich des Standard-compliants Mode des MSIE 6 empfehle ich u.a. dieses hier http://msdn.microsoft.com/library/default.asp?url=/library/en-us/dnie60/html/cssenhancements.asp
Gruß Gunther