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Hallo Hamza,
ich würde mal das MySQL Handbuch zu Rate ziehen. Die lassen sich da drüber aus:
http://www.mysql.com/documentation/mysql/bychapter/manual_MySQL_Database_Administration.html#Backup
Grundsätzlich ist die Methode die Dateien einfach zu kopieren wohl O.K., Du solltest nur die Tabellen temporär sperren.
Gruss
Marko