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Der Link ist "harmlos", darunter befindet sich noch ein 100 Pixel breites Blindgif, dessen Entfernung den Fehler nicht beseitigt. Der Link ist CSS-gestaltet, wie alle anderen (richtig funktionierenden) Menüverweise auch.
Konkret ist padding-bottom:75px; bei .menue dafür verantwortlich, soweit ich das sehen kann. Wieso benutzt du ein und dieselbe Klasse für td und die Link-Elemente? Löse es doch bspw. so:
#menue {width:16%;}
#menue {padding:6px; background-color:#6a7f54; font-weight:bold; line-height:150%;}
#menue a:link, #menue a:active, #menue a:visited, #menue a:hover {color:#ffffff; text-decoration:none; font-weight:bold;}
#menue a:hover {text-decoration:underline;}
#menue b {color:#00df00;}
So kommt padding gar nicht an die Links.
Und im Markup:
<td id="menue" valign="top">
<a href="http://www.theknuddel.com/index.html">Home</a><br>
<a href="http://www.theknuddel.com/knuddel.html"><b>Ich, Knuddel</b></a><br>
<a href="http://www.theknuddel.com/reise-index.html">Auf Reise</a><br>
<a href="http://www.theknuddel.com/karussell.html"><b>Mein Karussell</b></a><br>
<a href="http://www.theknuddel.com/kuehlschrank.html">Kühlschrank</a><br>
<a href="http://www.theknuddel.com/buecher.html"><b>Knuddel liest</b></a><br>
</td>
Das sollte für eine einheitliche Darstellung sorgen, das Blindgif für MSIe sollte mit der prozentualen Breitenangabe meines Wissens überflüssig werden, wobei ich es nicht im 5.x getestet habe, aber das ist ja hier nicht das Problem.