Hi,
also ehrlich gesagt versteh ich nicht so ganz, auf was du hinaus willst.
Was machst du mit JavaScript ohne html - mit was für einer "Art" Seite willst du es dann verknüfen? Und wieso wird das Skript dann verpfuscht und außer Takt gesetzt? Oder willst du nur nicht, dass das Skript direkt in einer html-Datei steht, sondern nur dort genutzt wird?
Wenn es das ist, dann schau mal hier:
http://selfhtml.teamone.de/javascript/intro.htm#javascriptdateien
Wenn nicht, dann poste bitte genauer was du willst.
MfG,
Arthur