Moin.
Du könntest die Ordnerstruktur so anpassen, dass die Pfade immer korrekt sind, oder die Pfade mit '/' beginnen, wobei nur noch der Servername relativ ist.
Ergänzung zu Tom2's Tipp:
Teile dem Browser über <base href="http://www.blabla.de"> die BasisUrl mit. Dann kannst Du alle Links mit / beginnen lassen.
Gruß Frank