Hallo,
Du benötigst ein 2D-Array:
http://de.selfhtml.org/javascript/objekte/array.htm
2D-Array anlegen:
var a=new Array(nzeilen) ;
for(var z=0;z<nzeilen;z++) a[z]=new Array(nspalten) ;
2D-Array füllen:
for (var z=0;z<nzeilen;z++)
for (var s=0;s<nspalten;s++)
a[z][s]=z*1000+s;
Und wie man HTML-Tabellen in 2D-Arrays überträgt (und zurück) erfährst Du hier: Tabellensortierer
Gruß, Jürgen