Hi,
Frage ist jetzt, warum ich nach dem erstellen wie gesagt keinerlei Rechte mehr habe, wenn ich über ein FTP Programm etwas machen muss?
Weil du vermutlich PHP als Modul hast und die Ordner dadurch als der user angelegt werden, unter dem der Apache (oder ein anderer Webserver läuft) läuft.
Entweder legst du die Ordner auch per FTP an oder verwaltest sie komplett per PHP. Alternativ kannst du PHP-CGI einsetzen, das wird (im Normalfall) als der gleiche User ausgeführet, wie dein FTP-Zugang.
BTW: Dazu gibts es bereits viele Beiträge im Archiv. Suchen hätte geholfen.